一般社団法人学校心理士認定運営機構は，以下の団体の賛同・協力を受けて活動しています。
社員である学会
- 一般社団法人日本教育心理学会
- https://www.edupsych.jp/
- 一般社団法人日本特殊教育学会
- https://www.jase.jp/
- 日本発達障害学会
- https://www.jasdd.org/index.html
- 一般社団法人日本発達心理学会
- https://www.jsdp.jp/
- 一般社団法人日本LD学会
- https://www.jald.or.jp/
- 一般社団法人日本学校心理学会
- https://schoolpsychology.jp/
- 日本応用教育心理学会
- https://www.naruto-u.ac.jp/facultystaff/takatam/jscep/index.html
- 日本生徒指導学会
- http://www.jagc.jpn.org/JAGC.html
- 日本学校カウンセリング学会
- https://sites.google.com/view/jsca-school-counseling/ホーム
- 日本コミュニケーション障害学会
- http://www.jacd-web.org/
- 日本学校メンタルヘルス学会
- https://plaza.umin.ac.jp/jasmh/index.html
協力団体
- 一般社団法人日本スクールカウンセリング推進協議会
- https://jsca.guide/
- 公益社団法人日本公認心理師協会
- https://jacpp.or.jp/index.php
- 一般社団法人日本発達障害ネットワーク（JDDmet）
- https://jddnet.jp/